福特汉姆大学本科生院为在读本科生提供各类荣誉课程。这些项目的课程主要为核心课程（CoreCurriculum）的改良版本。例如，福特汉姆大学荣誉课程中的“伟大著作”（Great Books）一课就是以研讨会的形式进行，学生需要就自己所选择的专业撰写一篇论文。大部分参加荣誉课程的学生在入学之初就被吸纳进入该项目之中，不过也有部分学生在大一结束时才选择加入。每个不同的项目会安排指定场所供学生学习，其中包括专供福特汉姆学院荣誉课程（Fordham College Honors Program）使用的阿尔法屋（Alpha House）和专供环球商务荣誉课程（Global Business Honors Program）的休斯礼堂（Hughes Hall）的一翼。

在毕业时，凡通过荣誉课程的学生可在毕业证书和成绩单上加注所获荣誉。